ستاد یکی از کاندیداهای مجلس خبرگان بعد از انتشار لیست «خبرگان مردم» مورد حمایت آیتاللههاشمیرفسنجانی و اعتدالگرایان، حضور خود در این فهرست که نامش در آن نبود را تکذیب کرد. این در حالی است که حجتالاسلام علیرضا اعرافی از ابتدا هم در لیست حامیان آیتاللههاشمی نبوده است و بعد از انصراف آیتالله محمدرضا ناصرییزدی، امام جمعه یزد، که ابتدا نامش در لیست خبرگان مردم قرار گرفته بود، نام آیتالله شاهآبادی جایگزین او شد. اعرافی، یکی از پنج نامزدی است که بهرغم دعوت به آزمون خبرگان، در امتحان شرکت نکرد و با این حال تایید صلاحیت شد. این در حالی است که بسیاری از روحانیان دارای سوابق طولانی در تدریس سطوح عالی حوزه علمیه قم، از جمله سیدحسن خمینی به دلیل شرکت نکردن در آزمون، ردصلاحیت شدند. چند سالی است که تمامی حوزههای علمیه ایران در خارج از کشور و نیز حوزههای علمیه قم که به تحصیل طلاب خارجی اختصاص دارد، در قالب «جامعه المصطفی العالمیه» تجمیع شده و به دست حجتالاسلام اعرافی سپرده شده است. وی اخیرا، امامت جمعه قم را نیز برعهده گرفته است.